01.08.2018
Автор: Светлана Васильевна

Ген рРНК («рДНК»)

RRNK.jpg

После того, как была открыта полимеразная цепная реакция (англ, polymerase chain reaction, PCR), появилась возможность амплифицировать практически любые участки генома. Для этого используются специфические праймеры, и полученные «амплификоны» либо сразу анализируют, либо приходится их дополнительно клонировать в бактериальной плазмиде. В обоих случаях все завершается «прочтением» последовательности на автоматическом секвенаторе.

Благодаря усовершенствованию этой методики на смену сравнительного анализа полноразмерного структурного гена рРНК («рДНК») размером в 500-2500 т.п.н. пришел сравнительный анализ всего оперона рРНК. Обработку данных стали осуществлять при помощи специальных компьютерных программ, позволяющих путем выравнивания нефрагментированных нуклеотидных последовательностей оценить совпадение анализируемого амплификона с последовательностью, депонированной в банке данных Genbank.

В пользу выбора именно рДНК на роль главного филогенетического маркера Воз и его последователи выдвигают одни и те же доводы:

— возникновение рибосом одновременно с клеткой и их безальтернативная роль в биосинтезе белка, следствием чего является их универсальность;

— присутствие высококонсервативных и относительно более вариабельных участков в полинуклеотидной цепи рРНК, что дает возможность оценивать как архаические, так и позже сложившиеся эволюционные связи;

— «изохронность», т. е. одинаковый темп дивергенции рибосомных генов вследствие постоянной скорости их мутирования у разных организмов, что исключает возможность ошибочной интерпретации быстро мутирующих «тахителических» (греч. tachos — быстрый и telos — результат) последовательностей как более архаичных, а медленно мутирующих «брадителических» (греч. bradis — медленный и telos — результат) последовательностей как менее архаичных;

— редко наблюдаемый горизонтальный перенос рДНК, что позволяет хронометрировать только дивергентную эволюцию.

Первый и второй аргументы не вызывают принципиальных возражений. Два других противоречат фактам, которые свидетельствуют о гетерохронией эволюции рибосомных генов, а также о часто наблюдаемом у прокариотов явлении «горизонтального» переноса генов. Этот рекомбинационный процесс может затрагивать даже гены, кодирующие рРНК.

Тем не менее, продуктивность подхода к анализу глобальной филогении, предложенного Возом, не вызывает сомнения, а полученные выводы служат краеугольным камнем современной мегаклассификации.



Не нашли подходящую информацию? Не беда! Воспользуйтесь поиском на сайте в верхнем правом углу.